Озеро Джангысколь расположено у подножия Северо-Чуйского хребта, примерно в 40 км от сел Курай и Кызыл-Таш на горном плато высотой 1750 м в долине реки Чуя.
Озеро Джангысколь находится в урочище Ештыкель на юго-востоке Республики Алтай, поэтому часто его называют озером Ештыкель. От Курайской степи плато Ештыкель отделяет небольшой перевал. Река Чуя находится в 4 км севернее озера и также отделена горами. На путешествие от Курая и обратно с осмотром достопримечательностей может уйти 5-6 часов времени.
Урочище Ештыкель с озером Джангысколь называют «Укоком в миниатюре». Чтобы увидеть плато во всей красе лучше подняться на вершину горки высотой примерно 120 м к западу от озера, туда где установлена геодезическая вышка. Красавцы-горы четырёхтысячники Куркурек (3982м) и Актру (4044м) в рассветный час становятся зеркальным отражением озера Джангысколь. За Вашей спиной можно увидеть Курайский хребет. Внизу в западной части плато, петляет река, огибая множество мелких озер в зарослях кустарника.
